نظام رتبه‌بندی وبومتریکس به ارزیابی حضور پژوهشی و آموزشی دانشگاه‌ها در وب از طریق وب سایت‌های دانشگاهی آنان می‌پردازد. براین اساس وب سایت دانشگاه‌ها و مراکز تحقیقاتی براساس ۴ شاخص ارزیابی می‌شوند.
تعداد صفحات وب دانشگاه در گوگل با وزن ۵ درصد، تعداد ارجاع یا لینک‌های برقرار شده از سایر سایت‌ها به سایت دانشگاه با وزن ۵۰ درصد، تعداد استنادات ۱۱۰ نویسنده پراستناد دانشگاه در گوگل اسکالر با وزن ۱۰ درصد و تعداد مقالات کیفی دانشگاه در بین ده درصد مقالات پراستناد موضوع مربوطه با وزن ۳۵ درصد ارزیابی و رتبه‌بندی می‌شوند. نتایج رتبه‌بندی دانشگاه‌های علوم پزشکی کشور را می‌توانید در فایل پیوست مشاهده فرمائید.